#C1655. J16 实践-7 相似基因
J16 实践-7 相似基因
J16 实践-7 相似基因
题目描述
大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列。它包含了4种核苷酸,简记作 A,C,G,T
。生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物。
在一个人类基因工作组的任务中,生物学家研究的是:两个基因的相似程度。因为这个研究对疾病的治疗有着非同寻常的作用。两个基因的相似度的计算方法如下:
对于两个已知基因,例如 AGTGATG
和 GTTAG
,将它们的碱基互相对应。当然,中间可以加入一些空碱基-,例如:
A | G | T | G | A | T | - | G |
---|---|---|---|---|---|---|---|
- | G | T | - | T | A | G |
这样,两个基因之间的相似度就可以用碱基之间相似度的总和来描述,碱基之间的相似度如下表所示:
那么相似度就是:。因为两个基因的对应方法不唯一,例如又有:
A | G | T | G | A | T | G |
---|---|---|---|---|---|---|
- | G | T | A | - | G |
相似度为:。规定两个基因的相似度为所有对应方法中,相似度最大的那个。
输入格式
共两行。每行首先是一个整数,表示基因的长度;隔一个空格后是一个基因序列,序列中只含 A,C,G,T
四个字母。
输出格式
仅一行,即输入基因的相似度。
样例输入
7 AGTGATG
5 GTTAG
样例输出
14
样例分析
如上所述。
数据范围
对于 的数据, 序列的长度 。